ИМБП основан в 1963 году по инициативе академиков АН СССР С.П. Королёва и М.В. Келдыша как организация по проведению фундаментальных исследований в области космической биологии и медицины; медико-биологическому обеспечению пилотируемых
космических полётов; разработке методов и средств обеспечения безопасности и жизнедеятельности, сохранения здоровья и поддержания работоспособности человека в экстремальных условиях.
ИМБП определён головным учреждением по проведению работ медицинского и санитарно-гигиенического обеспечения здоровья экипажей, подготовке и реализации российской национальной программы медико-биологический исследований и экспериментов на российском сегменте МКС в соответствии с Федеральной космической программой России.
ИМБП располагает специализированной стендовой базой, включая наземный экспериментальный комплекс для проведения исследований по пребыванию человека в условиях длительной изоляции и искусственной среды обитания, стенды для имитации физиологических и биологических эффектов невесомости и других факторов космического полёта.